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论文标题
SARS-COV-2于2019年12月下旬就已在法国传达(SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019)
论文作者来自法国塞纳-圣但尼医院集团、法国国家健康与医学研讨院和巴黎大学
发文时刻:2020年5月3日在线宣布在世界期刊International Journal of Antimicrobial Agents上。
引 言
法国于2020年1月24日报告了榜首批SARS-COV-2相关感染病例,2例病例均有前往我国武汉市的游览史。据咱们所知,这2例病例被认为是法国的榜首批确诊病例。COVID-19最常伴有流感样疾病(influenza-like illness, ILI)。当我国面对COVID-19迸发时,欧洲国家正与季节性流感作斗争。
鉴于COVID-19和流感样疾病之间的临床症状类似,因而咱们决议回忆性地在巴黎邻近的我院(指的是塞纳-圣但尼医院,下同)重症监护室(ICU)搜集的呼吸道样本中寻觅SARS-COV-2。
办法-回忆性剖析
选定的记载
咱们回忆性剖析2019年12月2日~2020年1月16日期间因ILI而住院的ICU患者的病历,入院时多重FilmArray PCR(可检测20种导致上呼吸道感染的常见病毒和细菌,包含流感病毒、常见冠状病毒,但不包含SARS-COV-2)测验成果为阴性。
我院收集的每份呼吸道样本均在ThermoScientific公司的-86°C冷冻室中冷冻,保存4年,以备进一步剖析。依据病历,对一起有ILI症状(发热高于38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛)和磨玻璃样暗影(ground glass opacity)的患者收集的样本进行SARS-COV-2 RT-PCR。样本挑选阐明见图1。
图1.用于测验的样本挑选进程。
COVID-19测验
在2020年4月6日~9日期间对14个选定的生物库进行了SARS-COV-2 RT-PCR测验。严厉按照Charité计划在QuantStudio7(Thermofisher)设备上进行针对SARS-COV和 SARS-COV-2泛基因组中编码包膜蛋白的E基因的RT-PCR测验。依据制造商的主张,用Gene finder COVID19 Plus RealAmp试剂盒(IFMR-45)对阳性成果进行验证(图2)。
这种试剂盒针对3个病毒基因(RdRp、E和N基因,别离编码病毒RNA依赖性RNA聚合酶、包膜蛋白和核衣壳蛋白)和细胞RNAse P基因进行细心的检测,以承认呼吸道样品的质量。
图2.按照Charité计划的RT-PCR测验成果。
研讨成果
在研讨期间,咱们的剖析中纳入了58例因ILI而住院的患者中的14例(24%)。其间1例样本为阳性,获取自一名42岁的在阿尔及利亚出世的男性,他在法国日子多年,是一名鱼贩子。
他的最终一次游览是在2019年8月期间前往阿尔及利亚。在他的症状呈现之前,他的一个孩子已呈现了ILI。他的病史包含哮喘和II型糖尿病。他呈现咯血、咳嗽、头痛、发烧等症状,继续4天,并于2019年12月27日前往急诊病房。
开始查看无反常,所做CT扫描显现双侧下叶磨玻璃样暗影(图3),入院时他有淋巴细胞削减症,C反响蛋白和纤维蛋白原升高,但原降钙素处于正常规模。在急诊病房收集的痰液样本中没有发现病原体。这名患者入住ICU,承受抗生素医治,因病况发作好转于2019年12月29日出院。
图3.在基线时进行胸部CT扫描。
讨 论
咱们报告了一例COVID-19患者,该患者比法国的榜首批报导病例早了一个月。入院时,这名患者呈现了之前在我国和意大利患者行列中常见的临床症状和放射学形式。确认榜首例感染患者具有严重的流行病学含义,这是因为它极大地改变了咱们对SARS-COV-2及其在法国传达的知道。
此外,因为这名患者与我国没有联络,最近也没有游览,这表明这种疾病在2019年12月底就现已在法国人群中传达。
还需求展开进一步的研讨来评价SARS-COV-2在法国境内的实践发作状况、2019年底和2020年1月期间SARS-COV-2在人群中的实践传达程度,并探究其时或许发作的未被注意到的逝世状况。到2020年5月10日,法国境内存在176782例COVID-19病例,其间26313例逝世,可是咱们的研讨成果表明,这些数字或许轻视了COVID-19的实践担负。
最近的2项研讨提示着大约18%~23%的SARS-COV-2感染者是无症状的;大约55%的感染者是由身份不明的感染者引起的。咱们的成果激烈支撑这两种观念,提出在2020年1月期间,许多无症状的患者没有被确诊出来,并促成了这一流行病的传达。
此外,因为这些成果改变了咱们对COVID-19疫情动态的了解,这也代表着用于猜测SARS-COV-2传达的演化和成果的几个模型或许是依据有误差的数据,需求依据疫情的实践概略做调整。
咱们的研讨存在几个局限性。首要,因为所进行的剖析是回忆性的,病历材料并不全面,或许遗漏了一些相关信息。其次,因为RT-PCR的灵敏度和或许危害样本质量的贮存技能,咱们无法扫除假阴性成果。为了尽最大或许防止任何假阳性成果,咱们采取了一切一般的预防措施,咱们经过两种不同的技能和不同的工作人员对测验成果进行验证。
第三,咱们将咱们的剖析约束在少量样本上,咱们将所选的医学记载约束在仅限于症状和胸部CT相符的ICU患者,即便大多数患者实践上有细微的症状。第四,咱们将剖析规模约束在其时多重FilmArray PCR测定成果为阴性的患者中,虽然文献中现已描绘了穿插感染的状况。
最终,咱们在巴黎北部区域进行了一项单中心研讨,该区域在这一流行病中面对着特别高的担负。这些约束或许解说着为何咱们只能在咱们研讨的人群中识别出一例SARS-COV-2感染者。
参考材料:
A Deslandes et al. SARS-COV-2 was already spreading in France in late December 2019. International Journal of Antimicrobial Agents, 2020, doi:10.1016/j.ijantimicag.2020.106006.
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